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文章标题 A comparative performance evaluation of imputation methods in spatially resolved transcriptomics data 中文标题 空间分辨率转录组学数据中的归因方法的性能比较评估 文章链接 https:// 阅读全文
posted @ 2023-03-05 11:06
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文章题目 Spanve: an Effective Statistical Method to Detect Spatially Variable Genes in Large-scale Spatial Transcriptomics Data 中文名： Spanve：一种检测大规模空间转录组学数 阅读全文
posted @ 2023-03-03 17:16
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问题描述 使用 jupyter lab password 命令 配置jupyter 密码 报错 思路 去换一个conda环境 找到其lib内部的 libffi.so.7文件 解决方法 ln -s 其他conda环境/lib/libffi.so.7 缺失文件的conda/lib/libffi.so.7 阅读全文
posted @ 2022-11-27 13:25
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问题 需要安装一个R的测试包 但是这个包没有在cran中 也没有在biomanager中 于是决定使用devtools-github安装 遇到问题 无法下载github上的R包 策略 使用local方法安装 先将包安装到本地 .zip 或者.tar都可以 然后使用： devtools::instal 阅读全文
posted @ 2022-11-27 13:25
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配置目录 建立仓库 1、点击“New project” 2、点击“Create blank project” 3、输入仓库名称，点击创建 4、仓库创建完成，个人仓库的地址如下： 这里要注意的是，仓库的ssh地址中有个端口号2200（即用的不是默认端口22） 将本地仓库与远程仓库连接 先安装git 软 阅读全文
posted @ 2022-11-27 13:24
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配置目录 建立仓库 1、点击“New project” 2、点击“Create blank project” 3、输入仓库名称，点击创建 4、仓库创建完成，个人仓库的地址如下： 这里要注意的是，仓库的ssh地址中有个端口号2200（即用的不是默认端口22） 将本地仓库与远程仓库连接 先安装git 软 阅读全文
posted @ 2022-11-13 20:51
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问题展开 学习生物信息的时候发现，需要将一个M * N的csv文件作为anndata文件的.X部分，一个M * 2的csv文件作为anndata文件的空间位置信息标识。 首先先读M*N的文件 mydata = pd.read_csv(denoised_result_path,sep='\t') 其次 阅读全文
posted @ 2022-10-20 09:09
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不说费话，直接上链接 廖雪峰老师的GIT教程 阅读全文
posted @ 2022-10-20 09:08
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Super函数用法 主要用于调用父类函数 代码演示 class A: def __init__(self): self.n = 2 print('此时执行A的自定义函数，self的n值为',self.n) def add(self, m): print('self is {0} @A.add'.fo 阅读全文
posted @ 2022-10-20 09:07
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今日阅读Linux程序设计第四版，找到一个使用mmap函数的实例 问题描述 该程序主要定义一个结构体，随后利用mmap，msync以及munmap函数对其进行内容追加，定位以及修改内容的操作。 先自己实现该代码，随后进行编译 #include <unistd.h> #include <stdio.h 阅读全文
posted @ 2022-10-20 09:07
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