管道工人刘亚军的技术基地

摘要： 摘要：随着单细胞测序技术的快速发展，越来越多的研究者开始关注单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹的推断。本综述旨在介绍单细胞RNA-seq数据分析中细胞发育轨迹推断的进展，并重点介绍该领域常用的软件包，以期对相关研究者提供帮助。 引言 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术为研究细胞间的异质性 阅读全文

摘要： AnnData是一个用于单细胞数据分析的Python类，由Scanpy团队开发。它主要用于存储和处理单细胞RNA-seq数据，并提供了丰富的功能和方法来进行数据预处理、分析和可视化。 AnnData对象中存储的是基因表达矩阵（Gene Expression Matrix）及其相关的注释信息，例如细胞 阅读全文

摘要： 摘要：随着单细胞测序技术的发展，生物信息学在单细胞数据分析方面取得了重要进展。本文将为生物和医学科研工作者介绍单细胞转录组测序数据生物信息分析的进展，重点介绍该领域的最新研究成果和常用软件包。 引言 单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术已经成为研究细胞异质性和功能的重要手段。为了从海量的单细胞 阅读全文

摘要： 摘要：单细胞转录组学是一种基于高通量测序技术的单细胞基因表达研究方法。近年来，随着测序技术的快速发展，单细胞转录组学已成为生物医学领域的重要研究手段。本文将介绍单细胞转录组学的基本原理、技术发展、应用以及存在的挑战。 引言 在传统转录组学研究中，研究者通常使用大量细胞的平均基因表达数据。然而，这种方 阅读全文

摘要： 摘要：转录组学是一门研究全套转录产物（包括 mRNA、非编码 RNA 和其他 RNA 类型）的科学，旨在揭示基因表达调控机制及其在生物过程和疾病中的功能。本文将对转录组学的发展历程、主要技术方法、研究领域以及面临的挑战进行概述，以期为生物和医学科研工作者提供一个全面的转录组学认识。 1.引言随着高通 阅读全文

摘要： 数据准备和质量控制 对原始数据进行质量控制，包括检查质量值、长度、GC含量等。 对原始数据进行去除低质量reads，过滤低复杂度reads，去除adapter序列等预处理。 序列比对和基因计数 使用HISAT2等工具将去除低质量和过滤后的reads比对到人类基因组上。 使用featureCounts 阅读全文

摘要： 生物信息学和医学信息学已经广泛应用于许多生命科学和医学领域。以下是一些重要的应用： 基因组学和转录组学：生物信息学在基因组学和转录组学方面的应用正在成为发现新基因、探索基因功能和预测疾病风险的关键工具。 药物研发：生物信息学在药物研发中的应用范围广泛，包括发现新药物靶标、评估候选药物的毒性和疗效、优 阅读全文

摘要： 阅读全文

摘要： 压缩感知（也称为压缩感知、压缩采样或稀疏采样）是一种信号处理技术，通过寻找欠定线性系统的解决方案来有效地获取和重构信号。这是基于这样的原理，即通过优化，可以利用信号的稀疏性从比Nyquist-Shannon 采样定理所需的样本少得多的样本中恢复它。有两种情况可以恢复。第一个是稀疏的，这要求信号在某些 阅读全文

摘要： 人脑计划( human brain project， HBP ) HBP是一项为期十年的大型科学研究项目，以百亿亿级超级计算机为基础，旨在建立一个基于ICT的协作式科学研究基础设施，使欧洲的研究人员能够推进神经科学、计算、和大脑相关的药物。该项目于 2013 年 10 月 1 日开始，是欧盟委员会 阅读全文