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EGFR: “Epidermal growth factor receptor”，表皮生长因子受体。别名：ErbB1，或 HER1 EGFR是ErbB基因家族的成员之一。ErbB基因家族包括了：EGFR（ErbB1）、HER2（ErbB2）、ErbB3、ErbB4。其中，HER2又称为ErbB2。 阅读全文
posted @ 2017-09-11 20:38
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灵敏度高 == 假阴性率低，即漏检率低，即有病人却没有发现出来的概率低。 用于判断：有一部分人患有一种疾病，某种检验方法可以在人群中检出多少个病人来。 特异性高 == 假阳性率低，即错把健康判定为病人的概率低。 用于：被某种试验判定为患病的人中，又有多少是真的患了这种病的。 好的检测方法：有高的灵敏 阅读全文
posted @ 2017-09-04 20:21
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摘要：
人类全基因组测序06 SNP(single nucleotide polymorphism)：有了10倍以上的覆盖深度以后，来确认SNP信息，就相当可靠了。 一个普通黄种人的基因组，与hg19这个参考基因组序列相比，会有350万个左右的SNP。又有大概2万个是落在外显子上的，而非同义的SNP有大概9 阅读全文
posted @ 2017-09-03 11:41
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摘要：
字符串方法： 字符串是一个有序的，不可修改的，元素是以引号包围的序列。单引号，双引号，三引号，str生成 字符串的修饰 a='novo gene' a.center() 让字符串在指定的长度居中显示，如果不能居中，默认以空格填充 -a.center(20,'*') 返回一个原字符串居中,并使用‘*’ 阅读全文
posted @ 2017-09-02 19:47
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illumina技术： 工具：flowcell(流动池)：8通道，每个通道都有 2种DNA引物 种在玻璃表面(用共价键连到Flowcell上)，这引物和文库中的接头互补 Flowcell：8个line，，line：上下两个表面，，面：3个扫描通道swath，，swath：16个方块tile 文库制作 阅读全文
posted @ 2017-09-01 12:05
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摘要：
实验二 知识点1：通常不是直接与系统打交道，而是通过一个叫做Shell的中间程序。 shell即是用户交互的界面，又是控制系统的脚本语言。常用的有bash. zsh, ksh, csh, 命令行模式：居然有6种，相互切换用Ctrl+Alt+F1-F6，实现。用用Ctrl+Alt+F7切回桌面模式。 阅读全文
posted @ 2017-09-01 09:50
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挑战：寻找新的处理海量数据和复杂性的方法。 生信：说了什么： 研究对象： 以核酸、蛋白质等生物大分子数据库 研究手段方法：数学、信息学、计算机科学 研究工具： 计算机硬件、软件、计算机网络 研究目的： 对浩如烟海的原始数据进行获取、加工、存储、分配、分析、管理、注释解释，使之成为具有明确生物意义的生 阅读全文
posted @ 2017-08-31 12:39
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导出数据库（sql脚本） mysqldump -u 用户名 -p 数据库名 > 导出的文件名mysqldump -u root -p --databases db_name > test_db.sql ##得到整个数据库，最全面；；不要--databases也行，就是不够信息全面 mysql导出数据 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:38
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扩展例子 插入一条记录 INSERT INTO 表名 [(字段1,…,字段n)] VALUES (值1,…,值n) 插入查询的结果 INSERT INTO 表名 (字段1,…,字段n) VALUES 子查询 例如：INSERT INTO Scores VALUES ("990301", "大学计算机 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:33
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MySQL Select version(); 当前服务器版本 Select database(); 查看当前工作数据库 Show databases; 显示所有数据库 Select user(); 或 select current_user(); 当前用户 Select curdate(); 或 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:27
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R语言数据导入 数据导入 1、保存和加载R的数据(与R.data的交互：save()函数和load()函数) a <- 1:10 save(a, file = "data/dumData.Rdata") #data文件为当前工作目录下的文件，必须存在 rm(a) load("data/dumData 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:15
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从神经网络说起：深度学习初学者不可不知的25个术语和概念（上） http://www.36dsj.com/archives/85406 1，神经元；2，权重；3，偏置:用来改变输入的范围。4，激活函数f(x)：将输入信号翻译成输出信号。最常用的激活函数有Sigmoid、ReLU 和softmax。5 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:11
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摘要：
• 打开文件返回文件对象 – file_object=open(file_name,access_mode='r') • 关闭文件对象 – file_object.close() • 文件对象的访问模式 – r 以只读的方式打开 – w 以写的方式打开（清空原有） – a 以追加方式打开 输入方法 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:08
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摘要：
1. Beautiful Soup的简介 2. Beautiful Soup 安装 可以利用 pip 或者 easy_install 来安装，以下两种方法均可 easy_install beautifulsoup4 pip install beautifulsoup4 Beautiful Soup支 阅读全文
posted @ 2017-08-30 20:01
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本文摘自：http://www.cnblogs.com/itech/archive/2009/04/10/1433052.html 1.Linux链接概念 Linux链接分两种，一种被称为硬链接（Hard Link），另一种被称为符号链接（Symbolic Link）。默认情况下，ln命令产生硬链接 阅读全文
posted @ 2017-08-02 17:04
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摘要：
摘自 ：https://wenku.baidu.com/view/a28c6336b90d6c85ec3ac6a1.html 模式识别的基本概念 一般认为，模式是通过对具体的事物进行观测所得到的具有时间与空间分布的信息，模式所属类别或同一类中的模式的总体称为模式类，其中个别具体的模式往往称为样本。 阅读全文
posted @ 2017-08-01 11:20
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摘要：
DOM，文档对象模型(Document Object Model)，是W3C组织推荐的处理可扩展标志语言的标准编程接口。 API，应用程序接口 (API:Application Program Interface)，API就是操作系统留给应用程序的一个调用接口，应用程序通过调用操作系统的API而使操 阅读全文
posted @ 2017-08-01 09:36
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nt 特指核酸碱基（nucleotide），mer作为希腊语演化来的词根表示单体，nt=nucleotide, 即核苷酸数，通常用于描述单链，如RNA, primer等bp 是描述核酸或脱氧核酸的大小主要是从碱基角度讲的.DNA双链结构是碱基配对的.base pair.bp=base pair, 即 阅读全文
posted @ 2017-07-31 11:14
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主要来自 ：http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准：一代测序了，故称之为黄金测序。 高通量测序最近这几年很火越来越火，但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆、养细胞、养细菌、杂蛋白的生物学家，究其原因Sanger测序还是测序届 阅读全文
posted @ 2017-07-31 10:12
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摘要：
A book that remains shut is but a block. 有书闭卷不阅读，无异是一块木头。 Whatever is worth doing is worth doing well. Progress is the activity of today and the assur 阅读全文
posted @ 2017-07-19 19:34
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