02 2013 档案

Some paper on NGS
摘要：BamView: visualizing and interpretation of next-generation sequencing read alignments[for other viewers, see the introduction section of this paper]Visualizing next-generation sequencing data with JBrowseA survey of tools for variant analysis of next-generation genome sequencing dataUsing GBrowse 2. 阅读全文
posted @ 2013-02-27 15:30 菜鸟的世界 阅读(194) 评论(0) 推荐(0)
Linux 求某一列平均值
摘要：假设有一个名为data的文本文件，内容如下：1.02.03.0要求这些数字的平均值，可用如下方法：cat data|awk '{sum+=$1} END {print "Average = ", sum/NR}'其中，$1表示第一列参考资料：http://lixjluck.iteye.com/blog/961271 阅读全文
posted @ 2013-02-21 16:29 菜鸟的世界 阅读(16199) 评论(0) 推荐(0)
Linux提取出文本中某一列
摘要：假设有一个名为data的文本文件，内容如下（有两列）：1 1.02 2.03 3.04 4.05 5.06 6.0要取出第一列可用如下语句：awk -F" " '{print $1}' data >out其中双引号中的表示的是两列之间的分隔符，这里是空格， $1表示第一列， >out表示把得到的结果输出到文件 阅读全文
posted @ 2013-02-21 16:26 菜鸟的世界 阅读(17012) 评论(1) 推荐(1)