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2018年6月22日

生信基础知识【04】GO和pathway分析

摘要： 非原创 参考资料： 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写，GO数据库分别从功能、参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标 阅读全文

posted @ 2018-06-22 11:59 微凉charles 阅读(23745) 评论(0) 推荐(0) 编辑

【Python爬虫】01：网络爬虫--规则

摘要： Python网络爬虫与信息提取 目标：掌握定向网络数据爬取和网页解析的基本能力。 the website is the API 课程分为以下部分： 1、requsets库（自动爬取HTML页面、自动网络请求提交） 2、robots.txt规则（网络爬虫排除标准）（合理合法的使用爬虫） 3、beaut 阅读全文

posted @ 2018-06-22 11:59 微凉charles 阅读(1338) 评论(0) 推荐(0) 编辑

生物信息学基础知识【03】二代测序原理

摘要： 二代测序原理： 1、DNA待测文库构建。 超声波把DNA打断成小片段，一般200--500bp，两端加上不同的接头2、Flowcell。一个flowcell，8个channel，很多接头3、桥式PCR扩增。每个DNA片段将在各自位置集中成束，每一束含有单个DNA模板的很多拷贝，目的：将碱基的信号强度 阅读全文

posted @ 2018-06-22 11:59 微凉charles 阅读(6335) 评论(0) 推荐(0) 编辑

【转录组入门】3：了解fastq测序数据

摘要： 操作：需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件，并且用fastqc软件测试测序文件的质量 作业：理解测序reads，GC含量，质量值，接头，index，fastqc的全部报告，搜索中文教程 具体步骤 【1】SRA文件转换成fastq文件 单个文件转换 多个文件批量 阅读全文

posted @ 2018-06-22 11:59 微凉charles 阅读(9240) 评论(0) 推荐(0) 编辑