摘要：
今天和一个做Affymetrix 的 expert 交流了一下，解决了几个我一直不太明白的问题。在Affymetrix Expression Array中 有个 参数，absent和present。对于一个probe，如果其信号值很低，Affymetrix认为这个probe对应的transcript没有表 达，因此信号可能来自噪音。absent 表示信号值不存在，present表示信号值存在。因此，在处理芯片的过程中，如果没有做replicate，对于absent的probe应该去掉，不使用。如果有replicate，可以用一定的统计模型来衡量这个probe的值是否可靠。造成一个probe的信 阅读全文
