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2021年10月29日
【基因组组装评估】转录组比对率
摘要: 做完基因组组装后,通常要评估基因组的质量,目前可以采用二三代数据比对回基因组看比对率和coverage,BUSCO,LAI等。转录组数据比对率也是我们常用的方法,通常可以排除转录组数据是否存在问题,也方便在后续注释中排除转录组数据样本的问题。 可以用HiSAT2比对来查看比对率: pe1=5_1.c
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posted @ 2021-10-29 14:27 BioATCG
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