摘要: 今天写的一个perl脚本需要调用samtools view,在系统bashrc中,使用简写view表示samtools view,然后再perl中使用简写,脚本如下:#!/usr/bin/perluse strict;use 5.010;my $datadir = shift;my @bamfile... 阅读全文
posted @ 2015-09-16 10:09 Namlike 阅读(410) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 以下这段翻译自SAMv1.pdf__________________________以下几个选项计算结果一样-c -f1 =-c -F12-c -f2 =-c -f2 -F4 = -c -f2 -F12-c -F12=-c -F524 # 0x4 + 0x8 + 0x200-c -F4 = -c -... 阅读全文
posted @ 2015-09-16 09:33 Namlike 阅读(2771) 评论(0) 推荐(0) 编辑