2018年7月11日
python 遍历字典
摘要： 遍历字典 阅读全文
posted @ 2018-07-11 13:33 maxsmile17 阅读(156) 评论(0) 推荐(0)
2018年7月10日
python 将输出写入文件
摘要： 加入以下模式，就可将输出写入文件 以上示例将a写入了result.txt中。 将输出写入文件，在需要看长片段的输出时很管用，例如， 比直接print要好许多。 阅读全文
posted @ 2018-07-10 17:06 maxsmile17 阅读(1541) 评论(0) 推荐(0)
001 拿石头游戏，blast思想初步
摘要： 【摘录整理自 N.C.Jones 和 P.A.Pevzner 著《生物信息学算法导论》】 游戏规则 2+2 战术 【每堆2两块石头】 3+3 战术 符号含义 ↑ 表示从A中拿走一块石头 ↖ 表示从两堆各拿走一块石头 * 谁这步是先手谁不用再玩，因为不会赢 ← 表示从B中拿走一块石头 位置（i，j）, 阅读全文
posted @ 2018-07-10 11:26 maxsmile17 阅读(284) 评论(0) 推荐(0)
David Sankoff 介绍学习链接
摘要： David Sankoff, 现任加拿大University of Ottawa的数学基因组学研究主席。他在McGill University大学学习，并与Donald Dawson一起研究概率理论获得博士学位，撰写了关于历史语言学的概率模型的博士论文。他1969年加入在University of  阅读全文
posted @ 2018-07-10 10:55 maxsmile17 阅读(374) 评论(0) 推荐(0)
Linux 修改文件夹和其中所有文件的权限
摘要： 修改文件夹和其中所有文件的权限，开放全部权限给同组 权限数值说明 三个数字的顺序分别是，文件所有者，所属组，其他人员 阅读全文
posted @ 2018-07-10 10:23 maxsmile17 阅读(783) 评论(0) 推荐(0)
2018年7月5日
python 去掉字符串中不想要的部分
摘要： 如果字符串是 >id1234567 但是我只需要id部分不想要‘>'怎么办？ 1. 字符串解决方法 2.正则表达式解决法 阅读全文
posted @ 2018-07-05 15:22 maxsmile17 阅读(2018) 评论(0) 推荐(0)
python 从命令行读入参数
摘要： 如何从命令行读入参数，比如希望的阈值是500 可以使用import sys，具体如下 如果有多个参数，可以继续处理，如sys.argv[2]，以此类推，也可以写一个循环 阅读全文
posted @ 2018-07-05 13:57 maxsmile17 阅读(633) 评论(0) 推荐(1)
python 直接if判断和is not None的区别
摘要： tmpName = '' if tmpName: print tmpName #没有输出 if tmpName is not None: print tmpName #有输出，是空行 阅读全文
posted @ 2018-07-05 13:47 maxsmile17 阅读(18004) 评论(0) 推荐(0)
python 正则匹配行开头为‘>’的行
摘要： 因为fasta文件格式通常为 >name1 ATGATAGTGTCTGTAGCTGACTGT AGTGCTGTAGATAGCTAGCTAGTC >name2 AGTCGATCGTAGTAGCTAGCTAGC AGTCGATGCTAGCTAGCTACGAAA 需要识别每次以'>'开头的行来区分每段编码 阅读全文
posted @ 2018-07-05 11:25 maxsmile17 阅读(2373) 评论(0) 推荐(0)
python 如何打开文件按行读取，并去掉末尾换行符
摘要： 1.按行读取 2. 去掉末尾换行符 3. 按行读取方法二 print line加逗号，可以忽略输出的换行符【python2】，在python3中可以写为 阅读全文
posted @ 2018-07-05 11:05 maxsmile17 阅读(18083) 评论(0) 推荐(1)