03 2021 档案

参考基因组fasta文件添加index
摘要：参考基因组fasta文件添加index 命令一 #faidx index samtools faidx *.fa 命令二 (投递任务时，500M内存够用) # bwa index bwa index -a bwtsw *.fa 命令三 #picard index java -jar picard.j 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:50 maxsmile17 阅读(1211) 评论(0) 推荐(0)
python class 调用
摘要：class 调用 class A(): def a(): test = A() test.a() 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:46 maxsmile17 阅读(127) 评论(0) 推荐(0)
python 判断两个数组是否是彼此的排列
摘要：判断两个数组是否是彼此的排列 return sorted(str1) == sorted(str2) 麻烦一些的做法 if str1 is None or str2 is None: return False char1=[] for i in str1: char1.append(i) check 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:44 maxsmile17 阅读(115) 评论(0) 推荐(0)
python 移除列表中某个值的第一个匹配项
摘要：移除列表中某个值的第一个匹配项 list.remove(obj) obj 是匹配的内容 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:42 maxsmile17 阅读(414) 评论(0) 推荐(0)
python 是否只包含唯一字符
摘要：判断string里是否只包含唯一字符 len(set(string)) == len(string) 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:41 maxsmile17 阅读(144) 评论(0) 推荐(0)
python 判断一个字符是否是中文
摘要：判断一个字符是否是中文 elif '\u4e00' <= i <= '\u9fff' i 为需要判断的字符 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:40 maxsmile17 阅读(734) 评论(0) 推荐(0)
python 安装模块
摘要：安装模块 python -m pip install module module 是模块名字 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:39 maxsmile17 阅读(63) 评论(0) 推荐(0)
不解压查看压缩包内容
摘要：不解压查看压缩包内容 使用 unzip -l 命令就可以查看压缩文件中内容 unzip -l 阅读全文
posted @ 2021-03-10 15:37 maxsmile17 阅读(587) 评论(0) 推荐(0)
如何用annovar下载数据库
摘要：主要参考annovar官网 https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/startup/ 里面写道 First, we need to download appropriate database files using an 阅读全文
posted @ 2021-03-10 14:31 maxsmile17 阅读(2948) 评论(0) 推荐(0)