PAML:用最大似然法分析系统发育目录1.简介 PAML能做什么 PAML不能做什么 如何运行PAML中的程序2.数据文件格式 序列文件格式 树文件格式3.Baseml 核酸替代模型 控制文件4.Basemlg5.Codeml 密码子替代模型 氨基酸替代模型 控制文件 密码子序列(seqtype =1) 氨基酸序列(seqtype = 2)6.Evolver7.Yn008.Mcmctree 简 介 化石校准 控制文件MCMCtree 和 Multidivtime 的差异 近似似然计算9.其他注释 分析大数据集和迭代算法 树形检索算法 生成引导数据集 迭代过程中的磨损记录 指定初始值 微调迭代算 Read More
posted @ 2011-05-17 10:34
ACE封印
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