摘要：###1.2.3绘制曲线、图示对于由指数函数和正弦函数相乘形成的新函数：$$y = e ^{ax}sinbx$$当a = -0.5，b = 2时，画出函数曲线，在曲线上标记极大值。```pythona = -0.5b = 2x = arange(0, 10, 0.01)y = exp(a * x)*... 阅读全文

摘要：# Pylab的使用学习使用Python进行科学计算，然而很难找到简单实用，又循序渐进的例子。正好手边有一本[《Matlab可视化大学物理学》](http://baike.baidu.com/link?url=yQQp1jUmdoSeXHMr6UQ_LCLkwKR7H9cPK6h2yx8s7A8QJ... 阅读全文

摘要：在使用Gromacs进行分子动力学模拟的时候，首先一步是将从氨基酸数据库下载得到的PDB文件处理为Gromacs所使用gro文件，使用pdb2gmx可以做到这一点。pdb2gmx命令的使用时有很多参数，需要细心设定。比如：1、若希望多肽两端闭合为NH2和COOH，需要在命令后面加上-ter参数，命令执行后会出现选择项，此时可以手动选择多肽两端闭合选项；#The protonation state of N- and C-termini can be chosen interactively withthe -ter flag. Default termini are ionized (NH3. 阅读全文