摘要: 1.三维分子类RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构RasTop:为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件CHIME:直接在浏览器中观看3D分子MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件raswin.exe.gz:rasmol(win)2.7.0.1 rasmol新版本及汉化版本CrystInfo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构PDViewer:PDB格式文件的查看程序Weblab Viewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子Weblab ViewerPro:三维分子浏览工具ICMLite:三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能VMD: 阅读全文
posted @ 2013-10-18 22:41 沉下心学习 阅读(3347) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 【实验目的】1、熟悉构建分子系统发生树的基本过程,获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识;2、掌握使用Clustalx进行序列多重比对的操作方法;3、掌握使用Phylip软件构建系统发生树的操作方法。【实验原理】在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。对于一个完整的进化树分析需要以下几个步骤:⑴ 要对所分析的多序列目标进行比对(alignment)。 ⑵ 要构建一个进化树(phyligenetic tree)。构建进化树的 阅读全文
posted @ 2013-10-18 21:15 沉下心学习 阅读(8737) 评论(0) 推荐(0)