摘要: 核心概念 "KEGG" : ,生物高水平功能是数据库。如果不是使用服务器来查询数据库,需要付费。 KO:KEGG ortholog,已知功能(function)的同源基因数据库。所有数据库里的功能都有这个编号,但是每个功能又还有别的编号,因为每个对象都同时扮演多个角色,存在于多个子数据中。 Path 阅读全文
posted @ 2018-12-12 18:32 Xeonilian 阅读(730) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 自动批量化拼接16S 正反向序列,并把合并的序列归类放到文件夹中。 阅读全文
posted @ 2018-12-06 13:33 Xeonilian 阅读(751) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 0 说明 以 的形式运行 文件。 确定需要的包安装在环境变量对应的 上,否则会显示找不到。 推荐直接打开 安装,而不是通过 安装。 1 安装R3.5.1 __if__ (已经安装) 确定版本是否 3.5.1 找到 例如:G:\R 3.5.1\ __else__ 去官网下载 "windows" "ma 阅读全文
posted @ 2018-11-20 16:30 Xeonilian 阅读(3741) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 实验室需要批量拼接正反向引物测得的16S rRNA gene sequences 阅读全文
posted @ 2018-11-20 16:05 Xeonilian 阅读(4279) 评论(1) 推荐(1)
摘要: 本文无计算机基础的学生,要如何为自己搭建在个人电脑上的工作环境,才能完成与服务器连接,数据传输,能安装管理运行R和Python相关的代码。还能进行简单的代码重用,能在修改中debug。怎么理解环境变量。 阅读全文
posted @ 2018-07-21 18:34 Xeonilian 阅读(2069) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 如何用python的ftplib模块批量下载NCBI数据库中的基因组数据 阅读全文
posted @ 2018-05-02 21:26 Xeonilian 阅读(3007) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 提交公司测定的细菌基因组草图数据到NCBI 阅读全文
posted @ 2018-03-29 14:38 Xeonilian 阅读(11553) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 利用PhraseExpress集成操作, 快速把Xmind或者其他图片,截取后导入到Anki中。 阅读全文
posted @ 2018-03-22 21:57 Xeonilian 阅读(2845) 评论(2) 推荐(1)
摘要: 就是刚刚做了这件事,觉得还挺麻烦的,记录流程。 北京现在推出用带有NFC功能的电话卡坐公交和付费,现在在推广阶段,能免费申请换卡。 前提 1. 你的号码是 北京 移动的。 2. 你有一个能收货的 北京 地址。 步骤 1. 登陆自己的移动账户,可以通过搜索 找到网上申请页面。 "这里是免费换卡链接 l 阅读全文
posted @ 2018-03-10 19:36 Xeonilian 阅读(2289) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 问题:获得目录中的 .fna 后缀的文件路径 通过 makeblastdb 能获得用于 BLAST 的数据库文件,这些文件包括原始数据 ,和几个在原名基础上增加后缀为名字的文件,例如 。 Blast 的时候需要指定的是 文件,而不是其他的那些。因此需要自动读取数据库文件夹中的不带后缀的文件。 如果做 阅读全文
posted @ 2017-12-11 17:43 Xeonilian 阅读(12676) 评论(1) 推荐(1)