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2023年2月1日
TCGA代码分析流程 - 3.1 生存分析前的数据整理
摘要: 生存分析只需要tumor数据,不要normal,将其去掉,新表达矩阵数据命名为exprSet;clinical信息需要进一步整理,成为生存分析需要的格式,新临床信息数据命名为meta。由于不同癌症的临床信息表格组织形式不同,这里的代码需要根据实际情况修改。 rm(list = ls()) optio
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posted @ 2023-02-01 16:19 小高不高
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RNA-seq测序方法及数据分析
摘要: RNA高通量测序(RNA-sequencing,缩写为RNA-seq)是目前高通量测序技术中被用得最广的一种技术。 RNA-seq可以帮助我们了解:各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异。 RNA-seq可以检测的差异有:正常组织和肿瘤组织的之间的差异,药物治疗前后基因表达的差异,发育过程中不同的
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posted @ 2023-02-01 11:09 小高不高
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