11 2019 档案

基于16s测序的微生物群落差异分析
摘要：https://www.sohu.com/a/214219431_278730 基于16s测序的差异分析无外乎就是物种差异，α 多样性差异以及β 多样性差异分析。最多，也就是基于PICRUSt，BUGBASE这类型的软件预测完功能后，再做一些功能差异分析。 常见的差异检验方法，可以分为两大类，一类是 阅读全文
posted @ 2019-11-30 08:54 HISAK
graphpad一直在旋转等待
摘要：Excel里存在蚂蚁线时，graphpad就会等待，无法运行到下一步 阅读全文
posted @ 2019-11-29 19:54 HISAK
lci与hci
该文被密码保护。
posted @ 2019-11-27 19:24 HISAK
Linux查看内存
摘要：cat /proc/meminfo 单位：kb _________________________ top 单位：kb _________________________ free 单位：kb _________________________ free -k free -m free -g 阅读全文
posted @ 2019-11-25 21:50 HISAK
python中的join()函数的用法
摘要：Python中有.join()和os.path.join()两个函数，具体作用如下： . join()： 连接字符串数组。将字符串、元组、列表中的元素以指定的字符(分隔符)连接生成一个新的字符串 os.path.join()： 将多个路径组合后返回 >>#对序列进行操作（分别使用' ' 、' - ' 阅读全文
posted @ 2019-11-25 17:40 HISAK
Mothur
该文被密码保护。
posted @ 2019-11-23 17:17 HISAK
mothur RDP
摘要：https://mothur.org/wiki/RDP_reference_files http://blog.mothur.org/2017/03/15/RDP-v16-reference_files/ 阅读全文
posted @ 2019-11-22 15:40 HISAK
科技作图
摘要：一插图制作基础知识 1、学术论文中插图的特点； 2、Adobe Illustrator和Adobe Photoshop绘图的区别； 3、什么是矢量图和位图； 4、什么是RGB颜色模式和CMYK颜色模式； 5、什么是分辨率、DPI、PPI; 二、杂志社对插图的要求 1、杂志社对投稿论文插图的要求； 2 阅读全文
posted @ 2019-11-22 14:57 HISAK
土壤测序
摘要：http://muchong.com/html/201707/11533409_2.html https://wenku.baidu.com/view/e9d7cef95ff7ba0d4a7302768e9951e79b89690b.html 细菌是用的通用引物27f/1547r，真菌用的ITS1/ 阅读全文
posted @ 2019-11-22 08:33 HISAK
NGS文库质检方法与注意事项
摘要：http://www.bioon.com.cn/sub/showarticle.asp?newsid=71908 文库的质量对于高通量测序（NGS）产出的数据质量至关重要。过低估计文库的质量，导致Clusters或多重模板太多，数据质量不高；过高估计文库的质量，导致数据读取量少，基因组覆盖率低，所以 阅读全文
posted @ 2019-11-21 20:58 HISAK
Local RDP classifier
该文被密码保护。
posted @ 2019-11-19 19:38 HISAK
Miseq 测序文库与上机
该文被密码保护。
posted @ 2019-11-15 17:00 HISAK
bcl文件
摘要：https://blog.csdn.net/likelet/article/details/8662056 https://www.plob.org/article/7492.html https://blog.csdn.net/chen_amiao/article/details/52890481 阅读全文
posted @ 2019-11-09 21:06 HISAK
MiSeq测16S文库时，为什么要加PhiX?
摘要：测定混合微生物群的16S的若干个片段，从其可变区的序列来进行菌落组成分序，已是很常用的实验方法。 自从MiSeq测序平台推出PE300的测序方式之后，用PE300来测16S的V1、V2、V3区，已成了最常用的菌落分析手段。 但是每次我提醒用户：在做16S文库测序的上机时，建议加入70%的PhiX文库 阅读全文
posted @ 2019-11-09 15:42 HISAK
高通量测序名词解释
摘要：https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/9794860.html 测序的黄金标准：一代测序了，故称之为黄金测序。 高通量测序最近这几年很火越来越火，但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆、养细胞、养细菌、杂蛋白的生物学家，究其原因Sanger测序还是测序届的 阅读全文
posted @ 2019-11-09 15:38 HISAK
测序仪
摘要：https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/11637792.html 近些年来，人类全基因组测序或全外显子组测序在临床上的应用越来越多，基因测序的价格越来越低，基因测序仪的也越来越便宜。许多大的医院也在开始考虑购买测序仪，建立自己的基因测序系统，用于各种相关疾 阅读全文
posted @ 2019-11-08 15:36 HISAK
the bootstrap value of RDP
该文被密码保护。
posted @ 2019-11-01 09:36 HISAK