08 2014 档案

统计学常用概念：T检验、F检验、卡方检验、P值、自由度
摘要：1,T检验和F检验的由来一般而言，为了确定从样本(sample)统计结果推论至总体时所犯错的概率，我们会利用统计学家所开发的一些统计方法，进行统计检定。通过把所得到的统计检定值，与统计学家建立了一些随机变量的概率分布(probability distribution)进行比较，我们可以知道在多少%的... 阅读全文
posted @ 2014-08-22 18:00 黎嫣 阅读(60422) 评论(1) 推荐(2)
cocharan-Armitage trend test
摘要：Cochran-Armitage trend test是我们常说的趋势卡方检验，一般是针对基因型的2*3列联表的。譬如说三种基因型，如果按照某一个allele来看，可以有0、1、2个拷贝，是有序的，我们要观察随着allele数目的增多，发病的比例是否有差异，那么就要用Trend test。而Pear... 阅读全文
posted @ 2014-08-22 16:19 黎嫣 阅读(3272) 评论(0) 推荐(0)
H-W平衡
摘要：hardy-weinberg平衡:标准定义————如果一个种群符合下列条件:1.种群是极大的；2.种群个体间的交配是随机的,也就是说种群中每一个个体与种群中其他个体的交配机会是相等的；3.没有突变产生；4.种群之间不存在个体的迁移或基因交流；5.没有自然选择,那么,这个种群的基因频率(包括基因型频率... 阅读全文
posted @ 2014-08-20 19:55 黎嫣 阅读(6305) 评论(0) 推荐(1)
旅行目录
摘要：登封少林寺、开封北京（长城、故宫）天津上海深圳苏州杭州西湖（西湖十景.龙井）嘉兴乌镇湖南张家界安徽黄山哈尔滨冰雕广西桂林山水（漓江）山西平遥古镇四川九寨沟陕西（华山、兵马俑）山东（济南大明湖、崂山、泰山）厦门鼓浪屿云南昆明大理丽江.玉龙雪山青海湖新疆西藏拉萨（布达拉宫、香格里拉）海南三亚（天涯海角）... 阅读全文
posted @ 2014-08-19 17:35 黎嫣 阅读(298) 评论(0) 推荐(0)
java相关
摘要：看牛人如何学习JAVAhttp://wenku.baidu.com/link?url=qmrPPsRjENp5vUNG-wfwdYYG20lCqr3oC5-jLgfVLksVCopMgIcnONlXmI56p8aHKYpQCgufhJLSZRB1_BnftxoiZh6wYllbIuLM85PgZ3K... 阅读全文
posted @ 2014-08-15 11:48 黎嫣 阅读(192) 评论(0) 推荐(0)
如何迅速成为Java高手
摘要：很多网友朋友问我学习Java有没有什么捷径,我说“没有，绝对没有!”。但是我却很愿意将自己学习的一些经验写出来，以便后来者少走弯路,帮助别人是最大的快乐嘛！要想学好Java，首先要知道Java的大致分类。我们知道，自从Sun推出Java以来，就 力图使之无所不包，所以Java发展到现在，按应用来分主... 阅读全文
posted @ 2014-08-15 11:25 黎嫣 阅读(202) 评论(0) 推荐(0)
新手如何学习java(java学习建议路线图)
摘要：怎么学习Java，这是很多新手经常会问我的问题，现在我简单描述下一个Java初学者到就业要学到的一些东西： 首先要明白Java体系设计到得三个方面：J2SE,J2EE,J2ME（KJAVA）。J2SE，Java2PlatformStandardEdition，我们经常说到的JDK，就主要指的这个，它... 阅读全文
posted @ 2014-08-15 11:20 黎嫣 阅读(485) 评论(0) 推荐(0)
单倍型
摘要：单倍型，是单倍体基因型的简称，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合；通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。按照某一指定基因座上基因重组发生的数量，单倍型甚至可以指至少两个基因座或整个染色体。与基因型的区别更进一步的讲，单倍型也是指一个染色单体里... 阅读全文
posted @ 2014-08-11 11:16 黎嫣 阅读(2893) 评论(0) 推荐(1)
eQTL
摘要：首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行... 阅读全文
posted @ 2014-08-11 10:12 黎嫣 阅读(16998) 评论(0) 推荐(0)
GWAS
摘要：GWAS的数据形式：SNP数据，即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态（0正常，1患病）的样例-对照数据。在遗传流行病学上，全基因组关联研究（Genome Wide Association Studies,GWAS）是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因，从而了解不同个体间的基... 阅读全文
posted @ 2014-08-11 10:04 黎嫣 阅读(1707) 评论(0) 推荐(0)
基因
摘要：具有遗传效应的DNA片段，是控制生物性状的基本遗传单位。结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。（1）原核生物结构基因：连续的，RNA合成不需要剪接加工；（2）真核生物结构基因：由外显子（编码序列)和内含子（非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列)，参... 阅读全文
posted @ 2014-08-11 09:41 黎嫣 阅读(568) 评论(0) 推荐(0)
【经验】研究生导师的肺腑之言
摘要：1. 如果平时几乎没看过英文原文，读不懂怎么办？ 其实我以前也根本没读过原文，也看不懂。这儿有个好办法：找一本中文经典的书籍，仅看某一节你感兴趣或与你相关的内容，然后先找一两篇英文的综述（review）认真阅读一下，不会的单词可用金山词霸查一查，也许你读第一篇文章需要花两天，你过两天再读第2遍时，你... 阅读全文
posted @ 2014-08-08 10:44 黎嫣 阅读(791) 评论(0) 推荐(1)
基因表达数据
摘要：基本概念基因表达数据反映的是直接或间接测量得到的基因转录产物 mRNA在细胞中的丰度，这些数据可以用于分析哪些基因的表达发生了改变，基因之间有何相关性，在不同条件下基因的活动是如何受影响的。它们在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面有重要的应用。目前，高通量检测基因组 mRNA 丰度的... 阅读全文
posted @ 2014-08-07 09:56 黎嫣 阅读(1470) 评论(0) 推荐(1)
怎样看paper 最有效率
摘要：thinking more after reading. Don't just read the papers.in addition, at begining, you'd better focus on abstract, introduction and discussion. little ... 阅读全文
posted @ 2014-08-06 21:17 黎嫣 阅读(1267) 评论(0) 推荐(0)
基因探针富集分析（GSEA）& GO & pathway
摘要：http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.htmlGO是Gene Ontology的简称，是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目，从分子功能（molecular function）、生物学过程（biological process）和细胞... 阅读全文
posted @ 2014-08-06 17:18 黎嫣 阅读(5315) 评论(0) 推荐(0)
Java语言与C语言之间的应用比较
摘要：http://book.51cto.com/art/200906/131809.htmC语言能干的Java也能干的如下：网络应用层协议服务程序开发：如WebServer、FTPServer、MailServer、DNSServer等都可以用纯Java语言来开发；嵌入式开发：基于Linux的嵌入式程序... 阅读全文
posted @ 2014-08-05 17:41 黎嫣 阅读(512) 评论(0) 推荐(0)
互信息应用于SNP特征选择的局限
摘要：互信息已广泛应用于特征选择问题，但应用在 SNP 选择上还存在着一些局限。第一，互信息只能衡量一个 SNP 组合与表型的相关性， 无法衡量多个 SNP 与表型的相关性。第二， 利用互信息排序 SNP 时，隐含着一个假设，即： SNP 间是相互独立的，不存在着依赖关系。然而事实上，SNP 间存在着广泛... 阅读全文
posted @ 2014-08-04 17:12 黎嫣 阅读(382) 评论(0) 推荐(0)
优化机器学习算法
摘要：在机器学习的应用背景是多种多样的，做实际工程必须学会如何根据 具体的问题评估一个学习模型的好坏，如何合理地选择模型、提取特征，如何进行参数调优。这些也是我以前做模式识别时欠缺的环节，所以在遇到识别率很低的情 况时，往往很困惑，不知道该如何改进：到底是应该改进模型改变特征、还是应该增加训练样本数量，到... 阅读全文
posted @ 2014-08-03 21:45 黎嫣 阅读(278) 评论(0) 推荐(0)
机器学习问题方法总结
摘要：机器学习问题方法总结大类名称关键词有监督分类决策树信息增益分类回归树Gini指数，Χ2统计量，剪枝朴素贝叶斯非参数估计，贝叶斯估计线性判别分析Fishre判别，特征向量求解K最邻近相似度度量：欧氏距离、街区距离、编辑距离、向量夹角、Pearson相关系数逻辑斯谛回归（二值分类）参数估计（极大似然估计... 阅读全文
posted @ 2014-08-03 21:26 黎嫣 阅读(706) 评论(0) 推荐(0)
十二生肖&天干地支
摘要：看相：http://baike.baidu.com/view/833122.htm?fr=aladdin八字：http://baike.baidu.com/view/17127.htm?fr=aladdin1鼠 2牛 3虎 4兔 5龙 6蛇 7马 8羊 9猴 10鸡 11狗 12猪天干地支简称“干支... 阅读全文
posted @ 2014-08-03 20:09 黎嫣 阅读(2248) 评论(0) 推荐(0)