1、安装samtools与bwa时:

  缺少zlib库

  下载zlib库

cd zlib/
CFLAGS="-O3 -fPIC" ./configure
make
make install

 然后在进入samtools 进行make

2、安装rpm包是 依赖而不能安装!

  rpm -ivh xxx.rpm --nodeps --force

  先强制安装!

  再用rpm -qa |grep xx 查找已经安装

  ldd查找需要的

  注:1.加上 --nodeps,意思不考虑依赖
    2.更狠的--force,强制安装
    可以在这两个之前试试--aid自己解决依赖

3、安装soapsnp是遇到缺少boost

  先配置boost

  下载boost 解压

  

1 ./booststria.sh
2 ./bjam -s HAVE_ICU=1
3 ./bjam install --prefix=/usr

  第一步完后生成bjam脚本

  其中第二步大约需要半个小时!

  将当前目录下编译好的头文件安装到相应位置:在/usr/include下有头文件夹boost,在/usr/lib下有boost的库

4、强力推荐各种tools

  如 cctools bedtools,samtools

 未完待续。。。
posted on 2014-11-20 11:34  零尘一度  阅读(528)  评论(0编辑  收藏  举报