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摘要： 用上面的代码可以将R包更新到最新版，需要注意的一点是，后面安装过程中，指定R包安装目录时，需设定在原R包所在目录下。这样可以将原R包中的安装包直接copy过来，并选择是否升级 阅读全文

摘要： 目前的R包中，很多包之间是互相依赖的。但R的namespace是有上限的。如果导入的包超过这个上限就会报错 这时候要修改R的环境配置，找到R文件夹下etc目录下的Renviron.site文件，将 这一行加入到Renviron.site文件中，然后重启R就可以了。linux和Mac下的R也只要修改下 阅读全文

摘要： 最新版的rMATS v4.0相比上一版本性能有了很大提升，处理双端测序数据时，结果没问题。但是分析单端数据时，出来的结果文件只有header，没有其他内容。最开始以为是数据有问题，测试了几个其他数据，双端测序数据都有结果，单端测序数据都没有结果。Google一下，有很多人碰到同样问题。 作者回复正在 阅读全文

摘要： 在Rstudio中运行代码 出现错误 这是因为+位于开头了，导致theme()语句无法与上一语句衔接，只需把+放在上一语句的末尾 阅读全文

摘要： 在R 语言中变量名不能以数字开头，而且变量名中最好不用特殊字符。如果通过read.table 等函数导入文本中，colname中以数字开头，导入后，会自动在数字前加个X 阅读全文

摘要： 为什么ls *中的*代表的是任意个数的字符，而正则表达式中的*表示的是前一个字符匹配0次或任意多次？而且ls 使用^匹配开头的字符时无效？ 这是linux下通配符与正则表达式的区别。其实，ls,rm,mv等命令并不支持正则表达式，而是支持通配符，sed,grep,awk等命令是支持正则表达式的。另一 阅读全文

摘要： samtools在内存与core大量使用时容易出错：如 samtools sort: failed to create temporary file "TCGA-B0-5117-01A-01R-1420-07/hisat2_result/tmp.0000.bam": Cannot send afte 阅读全文

摘要： 是c()写成C()的缘故... 阅读全文

摘要： 在用grep -w命令完成一个任务时，发现怎么弄最后都无法得出最后的结果，最后发现是linux下分隔符的原因。 新建一个test文件： 想了下，-w的作用是找出完全一样的那一列（filed），但在grep中（filed）的定义不止\t，现在看来还包括-，甚至还有别的特殊字符。解决办法是先用其他字符将 阅读全文

摘要： 今天有点眼花，用rm命令的时候没看仔细，用*正则表达式匹配时，误把一个运行了3，4天的结果给删除了。心在滴血啊。虽然网上有些可用于恢复的软件，但不知道好不好用啊。吸取教训：1.用rm和*正则匹配时一定要看仔细（千万别在头有点晕的时候使用）2.最后在自己的目录下建一个类似于mytemp之类的文件下，下 阅读全文