03 2021 档案

[论文笔记] ：MetaCell: analysis of single-cell RNA-seq data using K-nn graph partitions
摘要：论文是一种非参数方法将细胞分为不相交的细胞团，同时避免数据平滑 整个算法流程为: 1. 原始矩阵进行特征选择 2. 构建平衡KNN图：如果我们用传统的相似性网络作为基因的co-expr网络的时候，每个节点根据阈值的选择，不同节点的出度，入度都不一样，即每个节点的邻居节点个数是不确定的，这对于每个基因 阅读全文

posted @ 2021-03-19 17:00 若流芳千古 阅读(598) 评论(0) 推荐(0)

R语言里一些画图程序不能在循环里正常保存的解决办法
摘要：R语言里一些画图程序不能在循环里正常保存的解决办法 这个目前只知其然不知其所以然，但是解决问题是可以的。 Seurat里的DimPlot画图，单独使用的时候没有问题，用pdf+dev.off()可以正常输出保存图片，但是放在循环里却无法实现，原因不明。 但是解决办法也很简单，加一个print函数就可 阅读全文

posted @ 2021-03-10 08:13 若流芳千古 阅读(3111) 评论(0) 推荐(0)

python 图片处理（更新）
摘要：查看数据类型print(image.dtype)1unit8 转换成 float32先将图片转化为float32类型，再除以255，得到0-1之间的数 import numpy as npimage = image.astype(np.float32) / 25512float32 转换成 uint 阅读全文

posted @ 2021-03-09 19:52 若流芳千古 阅读(371) 评论(0) 推荐(0)

服务器跑代码小tips
摘要：1. 防止服务器的任务因断网中断（linux screen 命令详解） GNU Screen是一款由GNU计划开发的用于命令行终端切换的自由软件。用户可以通过该软件同时连接多个本地或远程的命令行会话，并在其间自由切换。 GNU Screen可以看作是窗口管理器的命令行界面版本。它提供了统一的管理多个 阅读全文

posted @ 2021-03-04 11:12 若流芳千古 阅读(404) 评论(0) 推荐(0)

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