2017年12月5日
数据分析—质控、过滤及结果分析
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posted @ 2017-12-05 17:32 爱笑的生信媛 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
2017年12月4日
测序数据分析—数据完整性校验及生产md5.txt校验文件
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posted @ 2017-12-04 12:58 爱笑的生信媛 阅读(0) 评论(0) 推荐(0)
2017年11月30日
生信实战流程(转+总结)
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posted @ 2017-11-30 17:33 爱笑的生信媛 阅读(1) 评论(0) 推荐(0)
生信数据分析—cmake
摘要： 1、进入自己目录： cd /home/liuwenfang/biosoft 2、在biosoft目录系建软件存放目录： mkdir cmake 3、下载cmake： https://cmake.org/download/ https://cmake.org/files/v3.10/cmake-3.1 阅读全文
posted @ 2017-11-30 12:16 爱笑的生信媛 阅读(185) 评论(0) 推荐(0)
生信数据分析—bamtools
摘要： 相关网站 http://www.biotrainee.com:8080/thread-764-1-1.html https://github.com/pezmaster31/bamtools/wiki/Building-and-installing（下载网站） 阅读全文
posted @ 2017-11-30 11:09 爱笑的生信媛 阅读(370) 评论(0) 推荐(0)
生信数据分析—Sam格式
摘要： http://www.biotrainee.com:8080/thread-763-1-6.html https://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf 阅读全文
posted @ 2017-11-30 10:22 爱笑的生信媛 阅读(147) 评论(0) 推荐(0)
生信数据分析—序列比对软件（转）
摘要： https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequence_alignment_software 阅读全文
posted @ 2017-11-30 09:58 爱笑的生信媛 阅读(205) 评论(0) 推荐(0)
2017年11月29日
GRCh38参考数据分析流程（转）
摘要： http://blog.csdn.net/xubo245/article/details/50858334（CSDN转） 阅读全文
posted @ 2017-11-29 17:26 爱笑的生信媛 阅读(809) 评论(0) 推荐(0)
常用文件解压命令
摘要： 1、tar.gz格式解压： 如liuwenfang.tar.gz 解压命令：tar -zxvf liuwenfang.tar.gz 2、.zip格式解压 如liuwenfang.zip 解压命令：unzip liuwenfang.zip 3、fna.gz格式解压 如liuwenfang.fna.gz 阅读全文
posted @ 2017-11-29 17:04 爱笑的生信媛 阅读(949) 评论(0) 推荐(0)
生信数据下载（转）
摘要： 需要了解的知识点： 测序仪原理 一、数据下载 生物信息学常见的数据下载，包括基因组，gtf，bed，注释 http://www.biotrainee.com/thread-857-1-1.html 各版本对应关系： http://www.bio-info-trainee.com/1469.html（ 阅读全文
posted @ 2017-11-29 15:23 爱笑的生信媛 阅读(592) 评论(0) 推荐(0)