摘要：samtools faidx 能够对fasta 序列建立一个后缀为.fai 的文件，根据这个.fai 文件和原始的fastsa文件， 能够快速的提取任意区域的序列 用法： samtools faidx input.fa 该命令对输入的fasta序列有一定要求：对于每条序列，除了最后一行外， 其他行的 阅读全文

摘要：一、甲基化测序技术 1、12种DNA甲基化测序技术 1）什么是DNA的甲基化呢？ DNA甲基化是指针对DNA序列上的CpG岛，由甲基化转移酶将S腺苷甲硫氨酸的甲基转移给胞嘧啶。其中，5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一个非常重要的表观遗传学修饰事件，该事件能够调控基因活性，并影响着如细胞分化、转录 阅读全文

摘要：背景： 1、为什么要从头测序组装基因组？ 基因组是不同表型的遗传基础；获得参考基因组是深入研究一个生物体全基因组的第一步也是必须的一步；从头测序组装能够对新的测序物种构建参考基因组； 2、为什么要研究全基因组？ 确定基因组中缺失了什么；确定难以生化研究的基因和pathways；研究感兴趣的pathw 阅读全文