摘要： 分享一个制作弦图的R包：ggbio. 以下是一个简单的使用实例，效果图和代码如下。library(GenomicRanges)set.seed(1)N <- 100gr <- GRanges(seqnames = sample(c("chr1", "chr2", "chr3"), size = N,... 阅读全文

摘要： Gephi是一款优秀的复杂网络分析软件，支持导入多种格式的文件。gexf格式是Gephi 推荐的格式，基于 XML。本文是一个用python写的简单Demo，示例如何生成一个典型的gexf格式文件。代码基于pygexf包（下载地址：https://github.com/paulgirard/pyge... 阅读全文

摘要： 分组统计数据集是很常见的需求，R中也有相应的包支持数据集的分组统计。自己尝试了写了段R代码来完成分组统计数据集，支持公式，感觉用起来还算方便。代码分享在文章最后。使用方式:step 1: source('AggregateSummary.R')step 2: pastecs_summary(mpg+... 阅读全文

摘要： Scala中implict的一种用法就是扩展现有类的方法，有点类似于.Net中的扩展方法（MS对扩展方法的介绍：扩展方法使你能够向现有类型“添加”方法，而无需创建新的派生类型、重新编译或以其他方式修改原始类型。）Scala中有两种方式做到方法的扩展，以扩展String为列：第一种（code:10-1... 阅读全文

摘要： 在VS2013中调试D3官网的一些Sample过程中遇到了一个奇怪的问题：凡是Sample中使用的数据源是json文件时候，smaple 就无法在浏览器中正常运行。经调试后发现根本原因是IIS Express 默认不允许浏览器下载客户端的.Json文件。解决方案自然就是更改IIS Express的a... 阅读全文

摘要： Scala中的集合对象都有foreach和map两个方法。两个方法的共同点在于：都是用于遍历集合对象，并对每一项执行指定的方法。而两者的差异在于：foreach无返回值（准确说返回void）,map返回集合对象。见如下代码及运行结果：b.getClass 得到的是void, 而c.getClass得... 阅读全文

摘要： 一、安装环境1、 JDK：jdk-7u79-linux-x64.tar.gz2、 HBase：hbase-0.98.13-hadoop1-bin.tar.gz3、 Hadoop：hadoop-1.2.1二、下载并解压HBase发行包,将hadoop下的hdfs-xite.xml 复制到HBase的c... 阅读全文

摘要： 先看下面这段代码，显然无法work. 因为代码试图在TestVariableScope()中引用一个没有被定义的变量a.所以必须报错，如下图-1. 不过如果你将第2行代码注释掉。代码就能跑通了，如图-2。 问题1来了：TestVariableScope.a 不是也没有被定义吗，为什么可以work呢？ 阅读全文

摘要： 在调试scala在线开发教程（http://www.imobilebbs.com/wordpress/archives/4911）的过程中看到了以下代码，但是这段代码无论怎么调试都无法成功。 1 abstract class Element{ 2 def contents:Array[S... 阅读全文

摘要： 系统：Ubuntu 64 bit系统step1:创建hive文件目录,并在hive目录下创建tmp,warehouse 和 log目录：Step2:解压hive安装包：Step3:创建配置文件：Step4:修改hive-site.xml:Step5:修改hive-log4j.properties:S... 阅读全文