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摘要: 仅有几个分布点的情况下,想绘制精确的物种分布图不是很容易,但可以粗略的利用几何图形表示物种的大致分布区。 首先在Arcmap中加载底图(海南省地图)和物种分布点(以GBIF上的Goniurosaurus hainanensis)为例。 我们需要用到最小边界几何工具 官方文档:http://pro.a阅读全文
posted @ 2018-07-02 13:52 钱天宇 阅读(107) 评论(0) 编辑
摘要: 首先导入图像,依次打开 Arctoolbox - Spatial Analyst Tools - Conditional - Con,在对话框中填入 输入图层,阈值,TRUE值填1或源图层,FALSE值填0 结果如图 调整一下颜色,加入行政区边界,使图片可读性增高阅读全文
posted @ 2018-07-02 11:39 钱天宇 阅读(61) 评论(0) 编辑
摘要: 气候数据在worldclim网站下载,高程数据在哪下的忘了,下好之后都是Tif格式。 将数据导入Arcmap中,用区域蒙版提取数据,提取好之后得到两种数据: 1:气候数据,2:高程数据 在这两个数据图层上点击右键,查看Properties,可以看到Cell size是不同的,Columns and 阅读全文
posted @ 2018-06-08 14:09 钱天宇 阅读(126) 评论(0) 编辑
摘要: 在我们需要将多个栅格数据统一到同样像素大小的时候,需要用到Resample工具。 ArcToolbox - Data Management Tools - Raster - Raster Processing - Resample 但在这之前,我们要查看目标图层像素的大小,在目标图层上点击右键-Pr阅读全文
posted @ 2018-06-07 21:06 钱天宇 阅读(85) 评论(0) 编辑
摘要: 首先加载广东省地图,和气候数据。 然后进行数据截取,这里需要用到的工具 ArcToolbox -Spatial Analyst Tools - Extract by Mask 将输入栅格选为需要提取的其后数据,mask data 选择省界地图。 提取过程有一个对话框。 提取成功后, 我们得到了以广东阅读全文
posted @ 2018-06-07 19:11 钱天宇 阅读(148) 评论(0) 编辑
摘要: link: http://rspatial.org/index.html#本网站提供空间数据分析和R建模的学习材料。R是一款在数据分析和图形化方面广泛程序语言和软件环境。R同时也具有先进的能力来处理空间、时空数据,并且为分析这样的数据带来了空前的机会(unparalleled opportuniti阅读全文
posted @ 2017-12-29 13:09 钱天宇 阅读(186) 评论(0) 编辑
摘要: 6.1 实例中使用的算法和数据的类型 物种分布建模已经用过了大量的算法。它们可以归类为‘框架(profile)’,‘回归(regression)’和‘机器学习(machine learning)’方法。框架方法只考虑‘存在(presence)’数据,而不是不存在或背景数据。回归和机器学习方法使用存在阅读全文
posted @ 2017-12-28 19:06 钱天宇 阅读(186) 评论(0) 编辑
摘要: 原载:http://blog.csdn.net/vivihe0/article/details/29826547 # 首先需要加载需要使用的两个package: library(maptools) library(rgdal) # 读取数据并绘图,下面读取的是中国行政区域的shapefile到变量x中: x=readShapePoly('bou2_4p.shp') # 现在...阅读全文
posted @ 2017-12-28 19:06 钱天宇 阅读(54) 评论(0) 编辑
摘要: 4.1 栅格数据 在物种分布建模中,预测变量通常被组织为栅格(raster)(grid)形式的文件。每个预测变量应该是一个代表感兴趣变量的‘栅格’,变量可以包含气候、土壤、地形、植被、土地使用情况等等。这些数据通常被存储在某种GIS格式的文件中。几乎用到了所有的相关格式(包括ESRI grid,ge阅读全文
posted @ 2017-12-28 19:05 钱天宇 阅读(280) 评论(0) 编辑
摘要: 5.1 模型拟合 模型拟合与存在于R中的建模方法在技术上十分相似。大多数方法使用formula来识别独立和依赖性变量,伴随着一个包含这些变量的data.frame。有关具体方法的详细信息,请参见本文档第三部分。 一个简单的公式可能看起来像:y ~ x1 + x2 + x3 ,也就是说,y是x1,x2阅读全文
posted @ 2017-12-28 19:05 钱天宇 阅读(96) 评论(0) 编辑
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