LoKwongho

想拥有计算思维的生物汪

2018年12月10日 #

[置顶] 我也有这张证书了~~

摘要: 阅读全文

posted @ 2018-12-10 22:59 LoKwongho 阅读 (46) 评论 (0) 编辑

2018年11月5日 #

[置顶] 记22岁生日

摘要:我迎着风 阅读全文

posted @ 2018-11-05 23:22 LoKwongho 阅读 (33) 评论 (0) 编辑

2019年9月22日 #

Octave作图

摘要:学物理化学的时候,遇到一些状态方程的公式,想到可以在计算机上做个图验证验证。。。 理想气体状态图: 阅读全文

posted @ 2019-09-22 21:09 LoKwongho 阅读 (3) 评论 (0) 编辑

2019年9月5日 #

Gauss Mixture 模型 和 EM 算法

摘要:恢复内容开始 一、与K-mean算法的比较: 二、Gauss Mixture 模型 有一组数据,直方图如左上。显然这样的分布不能用某一个单峰简单分布来描述,可以利用高斯混合分布来解决。 分布Y由两个高斯分布混合而成: 现在,我们要求未知参数 那么似然函数是这样的(基于N个已知数据的对数似然) 由于这 阅读全文

posted @ 2019-09-05 16:09 LoKwongho 阅读 (8) 评论 (0) 编辑

2019年8月29日 #

Docker初探:利用Docker运行samtools

摘要:跟着Dockerfile描述的过成,Docker创建一个类似虚拟机的环境,里面装好了runsamtools.py这个脚本要运行需要的东西。 写好了Dockerfile,准备好相关文件后,就创建image 成功后运行这个装在Docker中的脚本: 这里要考虑一个Docker容器和宿主机之间沟通的问题, 阅读全文

posted @ 2019-08-29 14:57 LoKwongho 阅读 (10) 评论 (0) 编辑

2019年8月14日 #

GATK流程--利用Pegasus : bwa算法简介

摘要:一 Pegasus是一个Workflow Management System。 利用它,设计一个DAG图作为一连串任务的流程,方便的进行并行、串行,并可从错误中恢复。 二、更多信息 https://pegasus.isi.edu/about/ 三、GATK illumina NGS的原理 https 阅读全文

posted @ 2019-08-14 19:22 LoKwongho 阅读 (35) 评论 (0) 编辑

2019年7月18日 #

ssh免密登录

摘要:免密登录的详解:https://www.cnblogs.com/lingyejun/p/7367596.html 大概流程: A免密登录到B 1. 在A端生成密钥对 ssh-keygen -t rsa 在.ssh下会生成两文件 2. 把.pub结尾的文件中的公钥追加到服务器上自己的用户根目录下的.s 阅读全文

posted @ 2019-07-18 10:05 LoKwongho 阅读 (21) 评论 (0) 编辑

2019年6月2日 #

github上传文件夹

摘要:创建一个仓库 获得地址 设置处添加公钥: 公钥的获得: cd 到.ssh文件夹,如下操作,一路enter 查出rsa_pub后,粘贴至下方 终端输入 ssh git@github.com 来看是否连接成功 接着如下输入 十分愚蠢地弄了一个下午 阅读全文

posted @ 2019-06-02 20:05 LoKwongho 阅读 (160) 评论 (0) 编辑

2019年1月14日 #

Linux 使用记1 fastx toolkit安装问题

摘要:1 安装fastx toolkit的时候,步骤按https://blog.csdn.net/LotusWang0723/article/details/78723409 其中可能会出现如下报错 可以找出问题文件,这样解决: 更多信息: https://reviews.freebsd.org/D148 阅读全文

posted @ 2019-01-14 11:26 LoKwongho 阅读 (194) 评论 (0) 编辑

2018年12月10日 #

我也有这张证书了~~

摘要: 阅读全文

posted @ 2018-12-10 22:59 LoKwongho 阅读 (46) 评论 (0) 编辑

2018年12月6日 #

动态规划问题总结

摘要:最大子列和问题 >> 6 >> -2 11 -4 13 -5 -2 << 20 最大不下降子序列 LIS 用一个pre数组来进行回溯,如果结果不唯一,可以用一个vector<int> pre[maxn] 来记录,然后DFS >> 8 >> 1 2 3 -9 3 9 0 11 << 6 << 11 9 阅读全文

posted @ 2018-12-06 19:40 LoKwongho 阅读 (20) 评论 (0) 编辑

2018年12月2日 #

5、补体

摘要:补体 一种在新鲜血液中能够帮助抗体裂解细菌的酶样活性物质 一、补体系统的成分 固有成分 ① C1-C9 ② Factor B、Factor D ③ MBL, MASP 补体调节蛋白 C1 inhibitor (C1-INH), C4-binding protein (C4-BP) 补体受体 二、补体 阅读全文

posted @ 2018-12-02 21:25 LoKwongho 阅读 (86) 评论 (0) 编辑

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