摘要: 目录 3C简介 技术类型及区别 数据下载 基本应用 3C简介 核心理念就是把真核细胞核里的DNA三维折叠结构给测序出来,一个最经典的模型就是远距离enhancer可以促进转录。 真核生物细胞核中的染色质通过折叠成高度动态、复杂的高级结构,调控基因的转录、复制,以及损伤修复等重要功能。理解染色质在细胞 阅读全文
posted @ 2021-03-01 17:12 Life·Intelligence 阅读(2439) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 这在drug target的分析上应用广泛,GWAS最终发现的只是SNP而已,而drug的target却是具体的基因,Genomic predictors就是用来填补这个坑的。 参考2019年的NG,看别人是如何处理的。【idea大家早就有了】 nGene eGene cGene VEP web t 阅读全文
posted @ 2021-03-01 15:49 Life·Intelligence 阅读(224) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 2023年03月13日 没想到还能继续RNA splicing的分析,之前确实做了一些分析,但都是跑流程,结果分析有很大漏洞,最核心的就是没有对整体丰度做校正,L-HSCR本身就有更多的splicing。 这在毕业答辩的时候被看出来了,但要修改已经来不及了。 又接触了几个其他的sc call spl 阅读全文
posted @ 2021-03-01 02:10 Life·Intelligence 阅读(2819) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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