摘要：哈斯温伯格定律 Hardy–Weinberg equilibrium（Hardy–Weinberg principle ，HWP）及检验 群体中代与代之间 等位基因频率（allele frequency）基因型频率（genotype freqency）恒定 f(AA) = p2 f(aa) = q2 阅读全文

摘要：SNPs，全称是single nucleotide polymorphisms，SNPs等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是：首先选择参考样本制作标准曲线，然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较，根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。 阅读全文

摘要：屡次尝试后的vep高效安装方式如下： Note VEP官网：https://asia.ensembl.org/info/genome/variation/index.html Note: 欢迎评论交流，转载请注明来源，谢谢。 阅读全文

摘要：Biopython1.序列赋值 转录（反转录） 翻译 反向互补2.读取序列文件，识别序列的属性信息。SeqRecord提供序列及其注释的容器属性：seq :一条生物序列id：基本ID，标识这条序列name：常用分子的名称description：序列分子的描述letter_annotation:是一个 阅读全文

摘要：Biopython 模块1.序列 赋值 Bio.Alphabet.IUPAC 提供蛋白质、DNA和RNA的基本定义，并提供扩展和定制基本定义的功能。1.1 DNA 字母表 基本字母：IUPACUnambiguousDNA每种可能下的歧义字母：IUPACAmbiguousDNA修饰后的碱基：Exten 阅读全文

摘要：1.打开网址https://www.coursera.org 注册，然后搜索想要学习的课程，不需要证书则免费 2.若视频一直缓冲或显示黑屏则需要修改C:\Windows\System32\drivers\etc\host文件,添加如下一行： 52.84.246.72 d3c33hcgiwev3.cl 阅读全文

摘要：因为如果kmer是偶数，我们会发现基因组上有些序列（如，CGCGCGCG， kmer=4）的Kmer在反向互补后得到的序列仍然是它自身！而这是不能允许的，因为这将导致你无法区分某段序列的kmer到底是属于它自身还是说只是来自于它的互补链！！这将会给解组装的de Bruijn graph带来极大的困难 阅读全文

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