摘要：group_by的价值在于对 从对整个数据框的数据处理，转换为对每个组内的数据处理。 如：> not_cancelled %>%group_by(year,month,day)%>%filter(rank(desc(arr_delay))<=10) %>% select(month,year,day 阅读全文

摘要：> rep(1:4,2) 复制向量两次 > rep(1:4,each=2) 向量内每个元素复制两次 > rep(1:4,each=2,times=3) 向量内每个元素复制两次，向量复制3次。 注： > rep(c("a","b","c"),each=3) #rep 字符串向量情景 [1] "a" " 阅读全文

摘要：需求： 1）与以前存在的样本名称相同的，筛选出来，这是重复样本，做减法，不后续实验 2) 重复样本中以前检测不合格的，加上，做后续实验。 准备工作： 1.unique的已存在样本列表 first_four_Sample<-read.csv("./first_four_Sample.csv") #如果 阅读全文

摘要：summarize() 即summarise(). 输出列包含group_by分组变量以及计算所得统计量 如： > flights %>% group_by(year,month,day) %>% summarize(delay=mean(dep_delay,na.rm=T)) # na.rm=T 阅读全文

摘要：x/sum() 计算x各个分量在总数中的比例 y-mean(y) 计算y各分量与均值之间的差异 %/% 整除 %%求余数 注：当一个向量中的值不够用时，这个向量会被循环使用。如1:3+1:10等价于c(1 + 1, 2 + 2, 3 + 3, 1 + 4, 2 + 5, 3 + 6, 1 + 7, 阅读全文

摘要：$dataframe %>%select($var1,$var2,$var3) #列名，但建议用这种。 $dataframe %>%select($index1,$index2,$index3) #列的位置 上述等效，但建议用列名选择。 如flights%>%select(year,month,da 阅读全文

摘要：tidyverse包内的新定义的数据类型，是data.frame的子类型。函数、操作上与data.frame类似。 tibble标识列类型： int integer 存储正数 dbl double 普通数值型数据，可正可复，可大可小，可含小数可不含 chr character向量或字符串。 dttm 阅读全文

摘要：%>% 管道函数读"then"，即然后 把左边值发送到右边的表达式，并作为右边表达式函数的第一个参数。 当操作多个数据集或函数时，使用%>%会更方便，更逻辑性。 R 其他含义的管道符号用的少，包括： %<>%　在%>%基础上，把右边的最终返回值返回给左边 %T>% 把左边值传入后，不产生任何返回值（ 阅读全文

摘要：1. 虽然说逗号的bug,但其实是多了个（ 2. read.csv 报： '<ca><c7>'多字节字符串有错 Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : 输入中没有多出的行 Cause： 阅读全文

摘要：mutate()添加新变量列，保留之前。注：如果没有赋予新值，则在原列基础操作，这种情况多在管道符。 注：新增列与已有列的行数会一致，也要求一致。 transmute() 添加新变量列，并删除现有列。 当与现有具相同变量名，则会覆盖现有变量名 mutate() 增加新列，可以基于现有列运算新列的值， 阅读全文

摘要：因子型（factor）表示编号或登记，是用来存储类别的数据类型，是离散的，与连续性值相对。如果把数字作为因子，那么在导入数据后，需要将向量转换为因子(factor)，而因子在整个计算过程中不再作为数值，而是作为“符号”。 讲的很好的R因子 data <- c(1,2,2,3,1,2,3,3,1,2, 阅读全文

摘要：ggplot2绘制柱形图和条形图，X轴变量默认按照输入的数据顺序绘制，Y轴变量和图例变量默认按照字母顺序绘制。因此在绘图前先排序。 geom_bar绘制柱形图包括单数据系列柱形图、多数据系列柱形图、堆积柱形图、百分比推挤柱形图。 X轴一般是类别型（）和序数型（按顺序绘制），Y轴为数值型。 当X是类别 阅读全文

摘要：软件包： install.packages("devtools") library(devtools) install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") Ref: https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/11224609.html 阅读全文

摘要：导入数据，观察数据，操作数据，可视化展示，关闭数据 data<-read.csv("xx.csv",header=1)#第一行是header,不是值 。 取数据时候，较有用的参数还有stringsasfactor=Fasle,这样就不会把所有的字符型变量转换成Factor因子。因子是不能用与字符串操 阅读全文

摘要：apply(X,MARGIN,FUN,...) 对矩阵、数据库、数组按行或列进行迭代计算，返回向量或数组或值列表。 apply系列函数有效替代R中比较慢的for循环。 X: 输入的数组、矩阵，如果是数据框会自动转换成矩阵 MARGIN:按行计算或按列计算，1表示按行，2表示按列。 FUN:调用的函数 阅读全文

摘要：cbind(df1,df2) 横向添加表格，表格变宽，增加列数 rbind(df1,df2，...) 纵向合并多个数据集，表格变长，增加行数， 类似cat命令，要求列数相同 例子： 表格融合：针对数据框没有很好的保持一致。可用函数R内置的merge() 和dplyr的_join()函数。注：merg 阅读全文

摘要：我从中学开始就立体，较多维的数据理解不强，所以这部分进度慢些很正常 R ggplot2绘图常用一维数据列表的数据框，所以常用到多行聚为列这个功能。 减列数，减维： 常用包：reshape2,tidyr以及聚集了tidyr等包的tidyverse。 创建例子df<-data.frame(x=c("A" 阅读全文

摘要：scale_colour_gradient()和scale_fill_gradient():指定双色梯度。顺序由低到高。 双色梯度low和high控制梯度两颜色。 例： ggplot() + geom_point(data = mtcars, aes(x = mpg, y = disp, color 阅读全文

摘要：学术图表 A picture is worth a thousand words 图表在论文中的作用： 1）真实、准确、全面地展示数据 2）以较小的空间承载较多的信息 3）揭示数据的本质、关系、规律 学术图表的原则：规范、简洁、专业、美观。 学术图表是为论文结论（conclusion）提供证据的诗句 阅读全文

摘要：Source 栏 运行当前选中代码： Command+Enter 打开文件：Command+O 保存当前文件：Command+S 关闭当前文件：Command+W 运行当前文件：Command+option+R 运行文件从开头到光标所在处代码：Command+option+B 运行文件从光标所在处到 阅读全文