摘要: 1.Seqkit提取 seqkit作为一个非常全能的软件,之前有多次利用到,本来早就该学习了,却一直拖欠了下来。这次要进行一个cds序列的提取,所以在此做一个记录。 目标:将含有多个转录本的Pep文件提取出只有t1序列。 提取现在文件的id序列表 seqkit seq pep.fa -n -i -o 阅读全文
posted @ 2025-01-20 22:29 饭团ft 阅读(204) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 转录本:由一条基因通过转录,由于可变剪切形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟mRNA。另外非编码RNA也可能有转录本的说法。 最长转录本:可变剪切一个基因得到多个序列长度不同的转录本,应选序列最长的进行数据分析。 CDS:蛋白质编码区,是与蛋白序列一一对应的DNA序列,不存在内含子。 提取物种所有的 阅读全文
posted @ 2025-01-20 22:27 饭团ft 阅读(414) 评论(0) 推荐(0)