摘要: log2(mean(case))- log2(mean(control))或log2(mean(case)/mean(control)) mean(case) 指的是case样本的平均表达值;control同理; 忙,没时间解释,先记录一下。 阅读全文
posted @ 2020-09-02 17:06 橙子牛奶糖 阅读(4631) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 最近在做甲基化分析,看到logFC值,突然好奇这个值是怎么转化过来的。 测试了一下,limma的logFC值与glm函数的Estimate值是一样的。 以下是limma包的结果,可以看到 logFC值为-0.09222974: logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B 阅读全文
posted @ 2020-09-02 17:01 橙子牛奶糖 阅读(3534) 评论(0) 推荐(1) 编辑