BWA软件

bwa,即Burrows-Wheeler-Alignment Tool

 

用法:

在进行 reads 的比对前,需要对 fasta 文件构建 FM-index。

 

BWA命令中可以分别调用这三个算法,如:aln/samse/sampe for BWA-backtrack

BWA-bactrack: 用于进行 Illumina reads 的比对。reads 的长度最大为 100bp。

 

 

参考来源:

http://www.chenlianfu.com/?p=2103

http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/181

posted on 2019-10-10 11:58  BPSO_mynotes  阅读(663)  评论(0编辑  收藏  举报

导航