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R中 %in% 的含义（from lzmcbody的回答）： 每个元素都会被判断一次，返回逻辑值。 ls() 列出当前工作环境中所有变量--GEO数据step1用到的 > ls() [1] "a" "dat" "gpl" "group_list" "gset" "ids" [7] "pd" "pro 阅读全文
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其实加载GEOquery包的时候就出现options()的这行代码 > library(GEOquery) 载入需要的程辑包：Biobase 载入需要的程辑包：BiocGenerics 载入需要的程辑包：parallel 载入程辑包：‘BiocGenerics’ The following obje 阅读全文
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所以打开读取GSE42872_series_matrix.txt.gz文件时，参数comment.char = "!"就表示!后面的注释文件不用读取。 > exprSet <- read.table("GSE42872_series_matrix.txt.gz",sep = "\t",fill = 阅读全文
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以GEOquery为例 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GEOquery") 阅读全文
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p <- ggplot(data_m, aes(x=variable,y=ID)) + xlab("samples") + theme_bw() + theme(panel.grid.major = element_blank()) + theme(legend.key=element_blank( 阅读全文
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> txt <- "ID;Zygote;2_cell;4_cell;8_cell + Gene_1;1;2;3;4 + Gene_2;6;5;4;5 + Gene_3;0.6;0.5;0.4;0.4" > txt [1] "ID;Zygote;2_cell;4_cell;8_cell\nGene_1 阅读全文
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> data[1:3,] ##data[1:3,]与data[1:3]的不同，前者访问前三行，后者访问前三列，等同于data[,1:3] untrt_N61311 untrt_N052611 untrt_N080611 untrt_N061011 trt_N61311 FN1 245667.66 4 阅读全文
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#加载R包 > library(psych)> library(reshape2)> library(ggplot2)> library(factoextra) ##提前把名为ehbio_salmon.DESeq2.normalized.symbol.txt的文件放在工作目录，以制表符分割的.txt 阅读全文
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>>> c = ['wonderful', 'yarn', 1, 2, 3] >>> c ['wonderful', 'yarn', 1, 2, 3] >>> d = [i * 2 for i in c] >>> d ['wonderfulwonderful', 'yarnyarn', 2, 4, 阅读全文
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字符串的一些方法： string.split(str) 以str 为分隔符（默认为空隔）切片string，如果num有指定值，则仅分隔num个子字符串. string.count(str) 计算str在string中出现的次数。 string.casefold() 将string所有的字符改为小写 阅读全文