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2023年8月31日

摘要: shell函数的return 语句和其他语言(比如 python java等)不一样 ① shell 函数中的return 只能返回整数 且是 0-255的整数 ② shell 函数中return 的返回值,只能存储到内置变量$?中 ③ shell 函数返回字符串,可以用 echo 语句 在shel 阅读全文
posted @ 2023-08-31 14:47 0820LL 阅读(783) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年8月24日

摘要: 阅读全文
posted @ 2023-08-24 09:54 0820LL 阅读(107) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年4月13日

摘要: 下载好第三方库,上传到服务器,用pip命令执行安装 通过pypi官网下载包 pypi官网提供各种Python的第三方库,主要提供Linux版本的后缀是".whl"和“.tar.gz”,可以搜索相关的包。 ".whl"文件离线安装(推荐) #以Markdown为例(默认文件在当前目录下) pip in 阅读全文
posted @ 2023-04-13 18:27 0820LL 阅读(92) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: awk可以使用自身变量NR和FNR来处理多个文件。NR:表示awk开始执行程序后所读取的数据行数。FNR:awk当前读取的记录数,其变量值小于等于NR(比如当读取第二个文件时,FNR是从0开始重新计数,而NR不会)。NR==FNR:用于在读取两个或两个以上的文件时,判断是不是在读取第一个文件。awk 阅读全文
posted @ 2023-04-13 12:00 0820LL 阅读(374) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年4月4日

摘要: 导入镜像文件 (无需解压) docker image load -i XXX.tar.gz 导出镜像并压缩 docker image save image:tag | pigz -p 8 > XXX.tar.gz docker image save image:tag | gzip -p 8 > X 阅读全文
posted @ 2023-04-04 17:18 0820LL 阅读(10) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年3月30日

摘要: ① 在你需要折叠代码的开始处加上 #region(开始折叠)② 在你需要折叠代码的结束处加上 #eddregion(结束折叠) 折叠后的效果 至于每个语言要怎么写这个东西,可以参考这张表 阅读全文
posted @ 2023-03-30 15:29 0820LL 阅读(78) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年3月23日

摘要: 待补充 阅读全文
posted @ 2023-03-23 19:14 0820LL 阅读(5) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Git 的五个区域 1.workspace:工作区,就是你在电脑里能看到的目录,也是编辑文件的位置。初始化工作空间或者工作空间 clean 的时候,文件内容和 index 暂存区是一致的,随着修改,工作区文件在没有 add 到暂存区时候,工作区将和暂存区是不一致的。 2.index/stage:暂存 阅读全文
posted @ 2023-03-23 18:59 0820LL 阅读(26) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年2月10日

摘要: dpkg、apt-get、apt是debain系列版本安装软件的工具,Ubuntu是再debain基础上开发出来的 apt-get是对dpkg的封装,apt是对apt-get的封装 dpkg不会自动安装依赖包,apt、apt-get会自动下载并安装依赖包 dpkg dpkg -i –force-al 阅读全文
posted @ 2023-02-10 11:18 0820LL 阅读(62) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年11月16日

摘要: 阅读全文
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2022年10月23日

摘要: 第一步:安装R VScode python3 第二步:安装vsCode插件 R 和 R Debugger 第三步:安装radian 第四步:安装R包:languageserver、httpgd、vscDebugger 第五步:配置参数 文件 => 首选项 => 设置 搜索r.rterm.window 阅读全文
posted @ 2022-10-23 22:43 0820LL 阅读(118) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年8月26日

摘要: 根据是否需要登录可分为:登录式 非登录式 根据是否交互可分为:交互式、非交互式 二者组合: 登录交互式:常用 通过用户名密码登录shell,或者 bash --login 新启动的shell 登录非交互式:不常用 非登录交互式:常用 子shell继承父shell环境变量 通过 bash 启动的she 阅读全文
posted @ 2022-08-26 16:04 0820LL 阅读(272) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年8月9日

摘要: 由于默认的源进行安装时,下载速度比较慢,最好切换为国内镜像; 国内镜像: 清华大学开源软件镜像站 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ 中国科学技术大学 http://mirrors.ustc.edu.cn/ 浙江大学开源镜像站 http://mirrors.z 阅读全文
posted @ 2022-08-09 18:10 0820LL 阅读(176) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年8月1日

摘要: .py文件 .pyw文件 .py是python的常用格式,.pyw也是python的常用格式,由python.exe解释,可在控制台下运行。 .pyc文件 .pyc文件是python文件的编译文件,执行速度要远快于.py文件,不能直接用文本编辑器进行编辑。 .pyc文件只是经过简单编译,并未加密,因 阅读全文
posted @ 2022-08-01 12:03 0820LL 阅读(1041) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年7月7日

摘要: 再 ubuntu 平台,使用 make 编译软件,出现以下报错 /usr/bin/ld: cannot find -lperl 此时需要安装 libperl-dev apt install libperl-dev /usr/bin/ld: cannot find -llapack: No such 阅读全文
posted @ 2022-07-07 15:43 0820LL 阅读(826) 评论(0) 推荐(1) 编辑

2022年7月6日

摘要: 本地安装 vscode 安装vscode插件:docker、Remote-development 远程服务器安装docker 首先在远程服务器的命令行启动docker容器 然后在vscode中点击左侧的docker图标,选择要连接的docker容器,右击鼠标选择“Attach Visual Stud 阅读全文
posted @ 2022-07-06 15:49 0820LL 阅读(551) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 用 docker 封装完流程之后,部署到服务器,发现 docker 容器中的 java 无法启动 查原因后,发现是因为修改了 apt 的源造成的,改用下面的 source.list 文件 问题解决 用下面的source.list,替换 /etc/apt/source.list 后,java 可以正常 阅读全文
posted @ 2022-07-06 15:41 0820LL 阅读(1221) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年6月24日

摘要: 通常情况bash设置全局环境变量:/etc/bash.bashrc 通常情况bash设置个人环境变量:~/.bashrc 但是docker再以非交互方式启动ubuntu容器时并不会执行上面的两个文件,而是直接执行指定的文件。因为下面的代码 此时需要配置环境变量需要使用参数 -e docker con 阅读全文
posted @ 2022-06-24 18:37 0820LL 阅读(518) 评论(0) 推荐(1) 编辑

2022年6月14日

摘要: 利用 cpan 安装 perl module 举例: cpan Bio::SearchIO cpan Bio::SearchIO::blastxml https://www.cpan.org/ https://www.cpan.org/modules/INSTALL.html 查看模块是否安装成功 阅读全文
posted @ 2022-06-14 17:18 0820LL 阅读(168) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年4月20日

摘要: ENTRYPOINT的查看方法 docker image inspect 镜像名称 docker run 的 --entrypoint 参数就是覆盖ENTRYPOINT(第6行或者第7行)命令的. 官方话说就是覆盖默认入口点 --entrypoint 后面跟的必须是可执行文件 例如 显得入口点是 e 阅读全文
posted @ 2022-04-20 10:37 0820LL 阅读(544) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年4月14日

摘要: 一、ubuntu18.04 Docker 离线安装 1.下载安装包 去官网下载docker 安装二进制包,选择适合自己的版本。这里下载的是docker-19.03.9.tgz,在centos7中安装(cento6无法使用,提示linux版本内核版本太低) 下载地址:https://download. 阅读全文
posted @ 2022-04-14 17:40 0820LL 阅读(357) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年4月12日

摘要: 在使用clusterProfiler时,KEGG注释包,可以自定义。毕竟许多物种的数据库是不完善的。现在就自定义一个KEGG.db的包,用于KEGG注释。 第一步,先去上述官方地址找到自己研究的物种在KEGG数据里的3字符缩写,比如:人的缩写是hsa #安装Y叔的包, #安装创建KEGG数据库的包的 阅读全文
posted @ 2022-04-12 17:34 0820LL 阅读(3070) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 拆分文件可以用 dd split csplit,通常用split比较方便,支持按行、按大小等分割文件 合并文件用 cat file1 file2 file3 >mergeFile 拆分合并后 用MD5值校验 md5sum file 在linux下,切割和合并文件可以使用split和cat命令来实现。 阅读全文
posted @ 2022-04-12 10:13 0820LL 阅读(96) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年4月11日

摘要: 当我们在linux中解压一个含有中文名字的压缩包如“资料.zip”时,如果直接使用如下的命令,将会出现中文乱码。 主要的原因是因为unzip在解压的时候会将编码转化为其内部默认的编码,而默认的编码根本不支持中文CP936编码。因此我们需要在解压的时候明确的指定需要使用的编码。 unzip -O ut 阅读全文
posted @ 2022-04-11 17:36 0820LL 阅读(3418) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在ubuntu执行命令是弹出以下提示 WARNING: terminal is not fully functional 解决方法: 修改环境变量 TERM export TERM=xterm 阅读全文
posted @ 2022-04-11 11:29 0820LL 阅读(461) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年3月14日

摘要: less 打开文件,其中的中文显示乱码 解决方法:可以在 ~/.bashrc 或者 etc/profile 文件中添加一下语句 export LESSCHARSET="utf-8" 阅读全文
posted @ 2022-03-14 18:37 0820LL 阅读(627) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: vim 打开文件是中文乱码 原因:Vim 编辑器的编码和文件编码不一致,导致 解决办法:将Vim 编辑器的编码和文件编码一致 Vim中设置:set encoding=utf-8 阅读全文
posted @ 2022-03-14 18:21 0820LL 阅读(148) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年3月7日

摘要: 一、软件的官网(有些可能无法访问,比如sorceforce) 二、aconda官网 三、 阅读全文
posted @ 2022-03-07 15:42 0820LL 阅读(55) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年2月9日

摘要: 通过 docker 拉取 ubuntu 镜像 docker pull ubuntu 使用该进行生成容器 docker run -it ubuntu 在容器中安装vim apt-get update apt-get install vim 阅读全文
posted @ 2022-02-09 16:38 0820LL 阅读(342) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年2月2日

摘要: 在某些Linux发行版本中,less命令似乎神奇地检测到一个gzip压缩文件并在运行时对其进行解压缩,因此您可以执行以下操作: less my_stuff.csv.gz 然而有些Linux发行版本却不行。其解决方式如下: 第一种,使用 zcat 命令: zcat my_stuff.csv.gz | 阅读全文
posted @ 2022-02-02 12:13 0820LL 阅读(570) 评论(0) 推荐(1) 编辑

2022年1月29日

摘要: https://www.jianshu.com/p/266c55c87978?utm_campaign=haruki $ bcftools index -t view.vcf.gz # 创建 .tbi 索引 阅读全文
posted @ 2022-01-29 15:12 0820LL 阅读(18) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月25日

摘要: ######## 设置命令提示符RED='\[\e[31;1m\]'Yello='\[\e[33;1m\]'Green='\[\e[32;1m\]'Pur='\[\e[35;1m\]'End='\[\e[0m\]'PS1="$Yello[$End$RED\u$End$Green@$End$Yello 阅读全文
posted @ 2022-01-25 11:34 0820LL 阅读(48) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: jq工具可以检查JSON的合法性,并把JSON格式化成更友好更可读的格式。 没有任何参数,jq只是输出JSON输入数据,这里输出数据已重新格式化。jq默认情况下输出格式的JSON。我们可以将少量的JSON数据通过管道传递给jq并获得格式正确的输出。 jq可以使用一个或多个过滤器作为参数。最简单的过滤 阅读全文
posted @ 2022-01-25 11:31 0820LL 阅读(280) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月23日

摘要: # 本地到服务器 docker cp 本地路径 容器id或者容器名字:容器内路径 # 服务器到本地 docker cp 容器id或者容器名字:容器内路径 本地路径 阅读全文
posted @ 2022-01-23 22:08 0820LL 阅读(87) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: https://blog.csdn.net/weixin_36140403/article/details/112674585 阅读全文
posted @ 2022-01-23 17:50 0820LL 阅读(351) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月20日

摘要: GATK 在官网中提供了resource bundle,里面包含了所需要的很多数据。目前提供FTP 和 Google Cloud bucket 2种下载方式,由于用不了Google,推荐使用FTP GATK官网推荐使用lftp工具进行访问ftp和下载数据,提前安装lftp,本次使用root 权限安装 阅读全文
posted @ 2022-01-20 19:04 0820LL 阅读(610) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://events.jianshu.io/p/e646ed57fa61 https://www.jianshu.com/p/51edb6b23143 阅读全文
posted @ 2022-01-20 19:01 0820LL 阅读(71) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年5月11日

摘要: Ctrl+Enter;有强制复制作用 http://www.360doc.com/content/19/0430/20/38017100_832588674.shtml 一、填充文本 二、填充公式 三、定位填充 四、不连续填充 阅读全文
posted @ 2020-05-11 12:33 0820LL 阅读(596) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: http://blog.sina.com.cn/s/blog_48e0ae280100nc7j.html 方法一 使用if语句和辅助列的方法 方法二 键盘操作:选择区域 --> 定位 --> 空值 --> Ctrl+Enter 阅读全文
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2020年4月27日

摘要: 基础部分:Numpy Scipy matplotlib pandas pyMysql 机器学习:scikit-learn xgboost 框架:tensorflow pytorch爬虫:lxml beautifulsop request自然语言处理:jieba NLTK Gensim 阅读全文
posted @ 2020-04-27 12:43 0820LL 阅读(230) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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