嵌合体序列


嵌合体序列由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下:

在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例,

在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列;

在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,进行延伸

在PCR过程中,大概有1%的几率会出现嵌合体序列,所以在16S 扩增子测序的分析中,需要去除嵌合体序列

 

 

 

参考资料:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html

posted on 2017-03-03 16:52  庐州月光  阅读(5121)  评论(0编辑  收藏  举报